Rozsahem menší je sbírka rukopisných hudebnin, čítá asi 5 000 jednotek. Obsahuje řadu opisů i autografů z 18. až 20. století. Řada hudebnin pochází z pozůstalostí a darů, ty jsou však většinou uloženy rozptýleně mezi ostatními hudebními rukopisy a tisky. Součástí sbírky hudebních rukopisů je též několik relativně samostatných celků, např. hudební sbírka kantorského rodu Strachotů, sbírka z kůru kostela v Kolči, vzácná sbírka generace kantorů a hudebníků Hü bnerů z Dlouhého Mostu atd. Rukopisné hudebniny mají signaturu 59 R, lístkový katalog se nachází ve studovně hudebního oddělení. Tyto cenné prameny jsou postupně zpracovávány i pro mezinárodní soupis hudebních pramenů RISM.
Dalším samostatným celkem fondu hudebního oddělení je sbírka korespondence (asi 400 jednotek), psaná významnými skladateli, hudebníky, hudebními vědci a nakladateli, převážně z 19. a 20. století. Dopisy jsou uloženy pod signaturou 59 L. Sbírka mikrofilmů obsahuje výběr tištěných i rukopisných hudebních dokumentů, většinou historického charakteru, zpřístupňovaných ke studijním účelům se zřetel na ochranu vzácných hudebních pramenů z České republiky i ze zahraničních knihoven.

• více než 5000 hudebních rukopisů, především z 18., 19., také 20. století, a to jak dobových opisů, tak autografů
• okolo 110 000 jednotek hudebních tisků od 18. století po dnešek
• více než 400 původních dopisů, psaných slavnými skladateli a hudebníky
• komplet takzvaného Mozartova památníku, jenž v Národní knihovně vznikl roku 1837 jako první Mozarteum na světě vůbec. Obsahuje reprezentativní výběr Mozartova díla, zejména v podobě historicky důležitých opisů a prvních tištěných vydání
• reprezentativní komplet jak zahraniční, tak domácí muzikologické literatury, hudebních časopisů a dalších druhů dokumentů
  (cca 9 300 jednotek)

• je sekretariátem České národní skupiny IAML
• je garantem spolupráce s jedinečnou světovou bibliografickou akcí v oblasti historických hudebních pramenů RISM

Studovna hudebního oddělení je v 1. patře hlavní budovy Klementina
(po schodišti od vrátnice, číslo dveří 133).

Skutečnou vzácností hudebního oddělení a celé Národní knihovny ČR je tzv. Mozartův památník. Představuje samostatný komplex přímých hudebních pramenů, ale i dalších dokumentů. Jeho těžištěm je kolekce dobových opisů a tištěných vydání Mozartových skladeb. Instituce Mozartova památníku byla založena v roce 1837, čtyři roky před proslulým

salcburským Mozarteem, jde tedy vlastně o první "mozarteum" v celosvětovém měřítku. Mozartův památník je nedílnou součástí "velkého" tématu "Mozart a Praha". Mozart Klementinum navštívil už při své první pražské návštěvě v lednu 1787.
Důvodem pravděpodobněbyly osobní kontakty, ale rozhodující byl asi věhlas Klementina a jeho sbírek. Vyčleněný fond Mozartova památníku je nyní uložen právě v hudebním oddělení NK ČR. Výsledkem úsilí předchozích let je jeho oživení a další rozvoj. Ke snahám Mozartova památníku v  NK ČR dnes patří soustavné shromažďování a vůbec faktografie o Mozartovi a jeho díle, včetně bibliografické evidence mozartovské dokumentace dostupné u nás i v zahraničí.
Mozartův památník je konečně jedinečným výrazem dlouhodobého obdivu, ba přímo kultu Mozartovy osobnosti a jeho díla v Praze.

Collection of the Music Department
1st floor - main staircase, door no. 133

The Department provides information on all aspects of music and musicology. The non-circulating collection of primary musical sources, secondary literature and reference tools may be studied together with special catalogues in the reading room.

The music collection highlights:

• more then 5000 music manuscripts - period copies as well as autographs, mainly from the 18th, 19th and 20th century
• about 110 000 vols. of printed music from the 18th cen-tury to the present
• more than 400 letters of famous composers and musicians
• so called Mozart Memorial which was established in the library in 1837 and became the first Mozarteum in the world. It contains a valuable collection of historically significant copies and first editions of Mozart's works
• large collection of Czech and foreign language musicological literature, journals and other materials

(ca 9300 v.)

Professional activities of the Music Department

The department serves as a Czech center for international research in music librarianship and documentation:

• acts as a Secretariat of the Czech National Branch of IAML (International Association of Music Libraries, Archives and Documentation Centers)
• is a guarantor for Czech cooperation with RISM (Répertoire internationale des sources musicales), a world-wide bibliography of music historical sources.